1. Керівник Спеціалізованої прокуратури у військовій та оборонній сфері Південного регіону

2. Перший заступник керівника Спеціалізованої прокуратури у військовій та оборонній сфері Південного регіону

3. Заступник керівника Спеціалізованої прокуратури у військовій та оборонній сфері Південного регіону

4.1. Відділ організації процесуального керівництва та нагляду за додержанням законів при проведенні оперативно-розшукової діяльності

4.2. Відділ підтримання публічного обвинувачення в суді та нагляду за додержанням законів при виконанні судових рішень у кримінальних провадженнях

4.3. Відділ приймання, опрацювання та аналізу оперативної інформації

5. Відділ процесуального керівництва у кримінальних провадженнях і

6. Відділ представництва інтересів держави в суді

7.  Відділ організації діяльності прокурора у провадженні у справах про адміністративні правопорушення

 9. Відділ ведення Єдиного реєстру досудових розслідувань та інформаційно-аналітичної роботи

12. Відділ кадрової роботи та державної служби