1. Військовий прокурор Південного регіону України

2. Перший заступник військового  прокурора Південного регіону України

3. Заступник військового прокурора Південного регіону України

5.1. Відділ представництва інтересів держави, протидії корупції у військовій сфері та в обороно-промисловому комплексі

5.2. Відділ організації представництва інтересів держави в суді та при виконанні судових рішень

6. Управління нагляду за додержанням законів, виконанням судових рішень у кримінальному провадженні та при проведенні оперативно-розшукової діяльності

6.1. Відділ нагляду з організації процесуального керівництва, підтримання обвинувачення в суді, додержання законів при виконанні судових рішень та координації правоохоронної діяльності

6.2. Слідчий відділ

6.3. Відділ організації участі прокурорів у суді та нагляду за виконанням судових рішень у кримінальному провадженні

7.  Управління процесуального керівництва

7.1. Перший відділ процесуального керівництва досудовим розслідуванням у кримінальному провадженні

 9. Відділ організаційного та правового забезпечення

12. Відділ фінансування та бухгалтерського обліку